Каменная Смоленская церковь, что неподалёку от центрального входа на кладбище, появилась в 1786 году благодаря усилиям первого настоятеля отца Георгия Петрова. На строительство храма ушло 5 лет. Проект церкви в стиле русского классицизма разработал отечественный архитектор Алексей Иванов. Икону Смоленской Божией Матери также написал русских художник Иван Акимов.

Во время наводнения 1824 года сама церковь пострадала мало. Серьёзно пострадали только подвалы, в которых хранились архивы. Но за время своего существования облик церкви неоднократно менялся – несколько раз храм ремонтировали, в разные годы было сделано несколько пристроек: Богословский предел в 1809 году, Ильинский предел в 1833 году. В 1892 году возвели предел во имя Василия Исповедника и Иоанна Крестителя. В советские годы церковь закрылась в 1940 году, а в 1946 богослужения возобновились.